正文
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第1章 來到EVA世界兩年
第2章 通過
第3章 準備
第4章 迎接
第5章 交談
第6章 交流
第7章 第六使徒，魚天使
第8章 魚天使，水中戰鬥
第9章 到達第三東京
第10章 嘖！難搞啊！
第11章 快樂的一家
第12章 去上學了
第13章 音樂天使來臨
第14章 苦戰！救援！轟炸！
第15章 好感
第16章 和明日香的日常
第17章 擊敗使徒
第18章 劍柄！扭轉！
第19章 談心
第20章 穿越時空的思念1
第21章 穿越時空的思念2
第22章 發現第八使徒
第23章 準備出發！
第24章 下潛！變數！
第25章 生機
第26章 新的劇情
第27章 這不是鋼鐵女友嗎？
第28章 被受邀請的真嗣
第29章 週末的約會準備
第30章 真嗣的自我懷疑
第31章 約會進行時
第32章 一笑風情
第33章 碰麵
第34章 夜空下演奏和表演
第35章 巨型機械出現！
第36章 準備迎戰
第37章 拯救，救贖，結束？
第38章 告彆
第39章 異常的平靜
第40章 停電了
第41章 前往NERV地下基地
第42章 擊敗，交代
第43章 葉落歸風，隨風飄去
第44章 真實的內心
第45章 隔閡，朗基努斯之槍？
第46章 空天使來襲！
第47章 不能逃避
第48章 愛，觸不可及
第49章 恐怖天使來襲！
第50章 風暴前暫時的寧靜
第51章 準備回中國
第52章 珍貴無價
第53章 花開人已散
第54章 留下回憶
第55章 改變還是本樣？
第56章 回程前的快樂時光
第57章 謎團，計劃，探查
第58章 交流，苦惱，無解，迷茫
第59章 坦白，模擬圓盤，分手
第60章 告知，警告
第61章 安慰，思緒
第62章 夜天使來襲
第63章 惡化，開始營救，真相？！
第64章 精神世界的交流
第65章 血腥，得救，無法抹去
第66章 新的駕駛員？新的傀儡插入栓？
第67章 細細談，慢慢走
第68章 三號機的到來，新的技能
第69章 心與心，他和她，到來
第70章 傀儡係統開啟，程式出現錯亂（上）
第71章 傀儡係統開啟，程式開始錯亂（下）
第72章 威脅，糾結難纏，最終的心願
第73章 離去，送行，真實的
第74章 迎擊！阻攔！鮮血如雨！
第75章 對戰，解鎖，糾結，（加持的過往下1章）
第76章 過去，現在，癲狂，選擇，決定
第77章 失敗？迴歸！未知？
第78章 阻止失敗，覺醒，一切纔剛剛開始
第79章 失去，討論，安慰
第80章 消失，解釋，不變，的愛
第81章 過往解說片段（碇源堂，赤木律子＆赤木直子的過往）準備進入
第82章 混亂，魅惑，出現，真假？阻止
暫退百天，高考過後再回來
番外篇：約定（1）
番外篇：心靈的交流（2）
番外篇：黃粱一夢（上）
番外：黃粱一夢（中）
番外篇：黃粱一夢（下）
番外篇：眾裡尋她千百度（上）
番外篇：眾裡尋他千百度（中）
番外篇：眾裡尋他《她》千百度（下）
番外篇：執手相看淚眼，竟無語凝噎（上）
番外篇：執手相看淚眼，竟無語凝噎（下）
第83章 糾結，動搖，不清？
第84章 過去遺忘的記憶，失去付出再和得到
第85章 碾壓？磨滅？不！反轉！！
第86章 彼此的呼喚，保險預備啟動。（冬月副司令的回憶，下1章）
第87章 人與人，棄子，加持——死！？
第88章 各自感受，各方的疑惑
第89章 痛，迷茫，明日香（堅強）的童年
第90章 黃哲田的係統介紹，內心深處的情況